Hasanayn Makhluf wurde am 6.5.1890 in Kairo geboren.
Als er elf Jahre alt war schrieb er sich in der Azhar ein. Er lernte auch bei seinem Vater Muhammad Hasanayn Makhluf. Im Juni 1914 erwarb er sein Abschlusszeugnis.
Unmittelbar danach lehrte er an der Azhar. Im Juni 1916 wurde er zum Richter an den Schar'iyya-Gerichtshöfen ernannt. Schließlich wurde er Ende 1941 Vorsitzender des Gerichts in Alexandria. Danach wurde er Präsident der religionsrechtlichen Aufsicht am Justizministerium. Dort wirkte er u.a. an der Reform der Schar'iyya-Gerichtshöfe mit.
Danach lehrte er drei Jahre an der Richterschule. Dann wurde er zum obersten Schar'iyya-Gerichtshof berufen und zum Mitglied des großen Gelehrtenrates der Azhar ernannt.
Am 5.1.1946 wurde er zum Staatsmufti Ägyptens ernannt. Das blieb er bis zum 7.5.1950. Auch danach gab er noch Fatwas heraus. Im März 1952 wurde er erneut zum Staatsmufti ernannt und blieb es bis zum 19.12.1954. Danach arbeitete er als Vorsitzender des Fatwaausschusses der Azhar.